首尔大学医院:利落检测出诱发糖尿足感染的病原菌 KIMA logo - 利用纳米孔测序技术,开发出新的细菌鉴定法- 比起现有的培养检查,表现出更优的性能,且检查时间更短 从左至右依次为文章燮(音)、李东渊(音)、朱健(音)教授葡萄糖数值高的糖尿病患者血液粘性高,血液循环不畅。尤其是远离心脏的脚要承受体重的强大负荷,因此具有更高的危险性。被称为“糖尿足”的糖尿病性足部疾病,是糖尿病患者脚部产生的溃疡、末梢神经病变。由于易产生感染,严重时甚至得截肢,因此是一种极为严重的疾病。首尔大学医院文章燮、李东渊、朱健教授组于7日表示,采用作为最新碱基序列分析法的“纳米孔测序技术”,可以准确掌握诱发糖尿病性足部感染的病原菌。在对患者的组织样本进行实验后他们发现,比起现有的培养检查,该方法的分析性能更佳,速度更快。研究组利用糖尿病性足部感染患者手术过程中采集的54个坏死组织样本,对新技术与现有培养检查的性能进行了比较。结果发现,新的纳米孔测序技术检测出了更多的综合性细菌感染。样本中约81%(44/54)被诊断为综合性细菌感染,而现有的培养检查的诊断率仅为约51%(32/54)。新诊断出的12例综合性细菌感染,在现有的培养检查中,或被误以为是单一细菌感染(10种),或是细菌鉴定本身失败(2例)。 图1.将新开发的16S测序(左)与现有的培养检查(右)的诊断结果进行对比* ■ 综合性细菌感染  ■ 单一细菌感染  ■ 培养失败 而且,测序技术可以掌握综合性细菌感染中最大量存在的细菌是什么,并可对各种细菌进行相对定量化。分析表明,测序技术发现最大量存在的细菌在现有的培养检查中却不能被鉴定出来的情况频繁发生。而培养检查鉴定出的细菌通过测序技术进行确认后却发现只存在少量病变的例子也屡见不鲜。此外,现有的培养检查无法检测出普雷沃氏菌属(Prevotella)、拟杆菌属(Bacteroides)等部分厌氧性细菌,但新的测序技术能检测出,由此表现出了优秀的敏感度。也就是说,本次研究发现,依靠培养检查的现有的糖尿病性足部感染病原菌的探索过程,并不能充分反映实际存在的细菌构成。而测序技术在分析速度方面也比现有的培养检查更为优秀。一般来说,培养检查经培养到把握情况需2-3天乃至1周的时间,而新的测序分析法大多在1天内即可确认病因菌。通过此次研究,在糖尿病性足部感染病原菌的准确诊断和治疗上又迈进了一步。临床遗传体医学科教授文章燮表示:“此次研究利用最新的分子遗传学技术,能准确诊断糖尿病性足部感染病原菌,有望为改善患者的预后做出贡献,本次研究通过揭示治疗起来难度很大的糖尿病性足部感染的原理,有可能改变现有的治疗模式。”此次研究刊登在国际学术杂志《糖尿病(Diabetes)》最新一期上。 +82-43-713-8999, 8998, 8997 kimakorea@khidi.or.kr

首尔大学医院:利落检测出诱发糖尿足感染的病原菌

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首尔大学医院:利落检测出诱发糖尿足感染的病原菌

July 12,2021

- 利用纳米孔测序技术,开发出新的细菌鉴定法

- 比起现有的培养检查,表现出更优的性能,且检查时间更短


 

从左至右依次为文章燮(音)、李东渊(音)、朱健(音)教授


葡萄糖数值高的糖尿病患者血液粘性高,血液循环不畅。尤其是远离心脏的脚要承受体重的强大负荷,因此具有更高的危险性。


被称为“糖尿足”的糖尿病性足部疾病,是糖尿病患者脚部产生的溃疡、末梢神经病变。由于易产生感染,严重时甚至得截肢,因此是一种极为严重的疾病。


首尔大学医院文章燮、李东渊、朱健教授组于7日表示,采用作为最新碱基序列分析法的“纳米孔测序技术”,可以准确掌握诱发糖尿病性足部感染的病原菌。


在对患者的组织样本进行实验后他们发现,比起现有的培养检查,该方法的分析性能更佳,速度更快。


研究组利用糖尿病性足部感染患者手术过程中采集的54个坏死组织样本,对新技术与现有培养检查的性能进行了比较。结果发现,新的纳米孔测序技术检测出了更多的综合性细菌感染。样本中约81%(44/54)被诊断为综合性细菌感染,而现有的培养检查的诊断率仅为约51%(32/54)。新诊断出的12例综合性细菌感染,在现有的培养检查中,或被误以为是单一细菌感染(10种),或是细菌鉴定本身失败(2例)。


 

图1.将新开发的16S测序(左)与现有的培养检查(右)的诊断结果进行对比


*  综合性细菌感染   单一细菌感染   培养失败 


而且,测序技术可以掌握综合性细菌感染中最大量存在的细菌是什么,并可对各种细菌进行相对定量化。分析表明,测序技术发现最大量存在的细菌在现有的培养检查中却不能被鉴定出来的情况频繁发生。而培养检查鉴定出的细菌通过测序技术进行确认后却发现只存在少量病变的例子也屡见不鲜。


此外,现有的培养检查无法检测出普雷沃氏菌属(Prevotella)、拟杆菌属(Bacteroides)等部分厌氧性细菌,但新的测序技术能检测出,由此表现出了优秀的敏感度。


也就是说,本次研究发现,依靠培养检查的现有的糖尿病性足部感染病原菌的探索过程,并不能充分反映实际存在的细菌构成。


而测序技术在分析速度方面也比现有的培养检查更为优秀。一般来说,培养检查经培养到把握情况需2-3天乃至1周的时间,而新的测序分析法大多在1天内即可确认病因菌。


通过此次研究,在糖尿病性足部感染病原菌的准确诊断和治疗上又迈进了一步。


临床遗传体医学科教授文章燮表示:“此次研究利用最新的分子遗传学技术,能准确诊断糖尿病性足部感染病原菌,有望为改善患者的预后做出贡献,本次研究通过揭示治疗起来难度很大的糖尿病性足部感染的原理,有可能改变现有的治疗模式。”


此次研究刊登在国际学术杂志《糖尿病(Diabetes)》最新一期上。


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